Gümrük Muhafaza Kaçakçılık ve İstihbarat Müdürlüğü aşağıdaki görevleri yerine getirir: 1. Kaçakçılığı Önleme ve Takip: Her türlü kaçakçılık faaliyetine yönelik önleme, izleme ve araştırma yapar. 2. Operasyon ve Müşterek Operasyonlar: Kaçakçılıkla mücadele kapsamında operasyon düzenler, gerektiğinde diğer kurum ve kuruluşlarla müşterek operasyonlara katılır. 3. İstihbari Bilgi Toplama: Bakanlık bilgi sistemleri ve veri tabanlarını kullanarak ulusal ve uluslararası kaçakçılık faaliyetleri ile ilgili istihbari bilgi toplar ve değerlendirir. 4. Adli Kolluk Görevleri: 4/12/2004 tarihli ve 5271 sayılı Ceza Muhakemesi Kanunu kapsamında arama, inceleme, el koyma, yakalama, gözaltına alma, ifade alma ve tutuklama işlemlerini yapar. 5. Devriye Görevleri: Müdürlüğün sorumluluk bölgesi dahilinde ve gerektiğinde Türkiye gümrük bölgesinde gümrük gözetimi ve kontrolüne tabi kara ve deniz taşıtlarını denetler.