Kayısı ile iyi uyum sağlayan ağaçlar, genellikle anaç olarak kullanılan türlerdir. Kayısı yetiştiriciliğinde yaygın olarak kullanılan anaçlar şunlardır: Zerdali: Verimli ve yüksek meyve kalitesine sahip olan zerdali anaçları, nematod, kireç ve kuraklığa karşı dayanıklıdır. Erik Anaçları: Özellikle taban suyu yüksek ve fazla su tutan killi topraklarda kayısı için erik anaçları önerilir. Myrobolan 29-C ve Pixy: Farklı topraklara uyumlu, kireçli topraklara dayanıklı ve kuraklığa orta derecede dirençli anaçlardır. Ayrıca, kayısı bahçelerinde şeftali gibi küçük taçlı ağaçlar, geniş taçlı kayısı ağaçlarının arasında dikilerek kullanılabilir. Kayısı yetiştiriciliği yaparken, bahçe yerinin seçimi, toprak işleme, sulama ve gübreleme gibi diğer faktörler de dikkate alınmalıdır.