Gübre çeşitleri genel olarak iki ana kategoriye ayrılır: organik gübreler ve kimyasal (yapay) gübreler. Organik gübreler: Hayvan gübreleri: Büyükbaş, küçükbaş veya kümes hayvanlarının dışkıları. Kompost: Bitkisel ve hayvansal atıkların çürümesiyle elde edilir. Solucan gübresi: Solucanların organik atıkları sindirmesiyle oluşur. Yeşil gübre: Toprağa faydalı bitkiler ekilip sürülmesiyle elde edilir. Kimyasal gübreler: Azotlu gübreler: Üre, amonyum nitrat, amonyum sülfat. Fosforlu gübreler: Süperfosfat, triple süperfosfat. Potasyumlu gübreler: Potasyum sülfat, potasyum nitrat. Kompoze gübreler: Azot, fosfor ve potasyum içeren karışımlar. Yavaş salınımlı gübreler: Azotun yıkanarak kaybolmasını önleyen gübreler. Ayrıca, organomineral gübreler de hem organik hem de mineral besin maddeleri içeren bir türdür.