Matrix filmi, insanlığın makineler tarafından yaratılan bir simülasyonda (Matrix) yaşadığını ve insanların bu gerçeklikten habersiz bir şekilde var olmaya çalıştığını anlatır. Filmin bazı temaları: Özgürlük ve kontrol: Karakterler, Matrix’ten kurtulup gerçek özgürlüğe ulaşma mücadelesi içindedir. İnsan ve makine ilişkisi: Film, teknolojinin insanları nasıl manipüle edebileceğini ve insanın makineye olan bağımlılığını ele alır. Kendini keşfetme ve dönüşüm: Neo’nun, gerçek potansiyelini ortaya çıkarma yolculuğunu işler. Felsefi ve dini referanslar: Film, Gnostisizm, Budizm ve Hristiyanlık gibi farklı dini ve felsefi öğretilerden esinlenen unsurlar içerir. Ayrıca, film, izleyicileri varoluşsal sorular sormaya ve kendi gerçekliklerini sorgulamaya teşvik eder.