Matrix'in ilk bölümü, insanların ürettiği makinelerin (yapay zekanın) gelişmesi sonrası, makinelerin yarattığı bir simülasyonda tutsak olduklarını bilmeden yaşayan insanları konu alır. Filmin özeti şu şekilde: - Thomas Anderson (Neo), gündüzleri saygın bir yazılım firmasında bilgisayar programcısı olarak çalışırken, geceleri "Neo" takma adıyla bir hacker olarak faaliyet gösterir. - Neo, esrarengiz şekilde Trinity ve Morpheus ile tanışır ve yaşadığı dünyanın aslında bir simülasyondan ibaret olduğunu öğrenir. - Neo, Morpheus'un önderliğindeki ekibe katılarak, Matrix'ten kurtulmaya ve makinelere karşı verilen savaşın en önemli parçası olmaya çalışır. Film, istenmeyen distopik bir geleceği tasvir eder.