Neon Genesis Evangelion animesi, kıyamet sonrası bir dünyada geçen ve meka savaşlarını konu alan bir hikayeye sahiptir. Ana temalar arasında, farklı duygusal sorunlar ve akıl hastalıkları yaşayan karakterlerin psikoanalizi, varlığın doğası ve gerçekliğin sorgulanması yer alır. Projenin amacı, insanlığın evrimini tamamlamak ve Human Instrumentality Project olarak adlandırılan bir planla, tüm insanların tek bir varlıkta birleşmesini sağlamaktır. Yönetmen Hideaki Anno, seriyi yaratmadan önce klinik depresyon geçirmiş ve serinin psikolojik yönü, kendi hastalık döneminde yaşadıklarını temel almıştır.