Pomodoro tekniğinde şu şekilde mola verilir: 1. 5 dakikalık kısa mola: Dört pomodoro tamamlandıktan sonra, yani toplamda 100 dakika çalışma ve 5 dakikalık kısa molalar verildikten sonra, 5 dakika mola verilir. 2. 15-30 dakikalık uzun mola: Dört pomodoro tamamlandıktan sonra verilen 5 dakikalık kısa molalar yerine, 15-30 dakikalık daha uzun bir mola verilir. Bu yapı, zihinsel yorgunluğu azaltır ve motivasyonu yüksek tutar.