Gümrükte millileştirme işlemi, genellikle ithalat işlemlerinde gerçekleştirilir ve aşağıdaki adımları içerir: 1. Depo Tanımlaması: Sistemde iki depo tanımlanır: MERKEZ ve ANTREPO. 2. Malzeme Girişi: İthalat malzemesi, mal alım faturası ile antrepo deposuna giriş yapılır. 3. Masrafların Eklenmesi: İthalat bedeli, gümrük bedeli gibi masraflar, hizmet alım faturası ile antrepo deposuna kaydedilir. 4. Maliyetlendirme: İşlem yapılan ithalat dosyası üzerinde, stokları maliyetlendirmek için "stokları maliyetlendir" seçeneği kullanılır. 5. Sair Çıkış Fişi: Millileştirilecek malzeme, "sair çıkış" fişi ile çıkış yapılır ve depo olarak antrepo seçilir. 6. Sair Giriş Fişi: Sair çıkış fişi ile yapılan işlem sonucunda, malzeme merkez depoya "sair giriş" olarak kaydedilir. Ayrıca, transit yakıtın millileştirilmesi için, 4458 sayılı Gümrük Kanunu'nun 176. maddesi ve Gümrük Yönetmeliği'nin 482. maddesi dikkate alınmalıdır.