Şekib Avdagiç, Nisan 2018'den itibaren İstanbul Ticaret Odası (İTO) Yönetim Kurulu Başkanı olarak görev yapmaktadır. Ayrıca, çeşitli kurumlarda aktif rol üstlenmektedir: TOBB (Türkiye Odalar ve Borsalar Birliği) Başkan Yardımcısı; HİB (Hizmet İhracatçıları Birliği) Yönetim Kurulu Başkanı; THY Yönetim Kurulu Başkan Vekili ve İcra Kurulu Başkan Vekili; İTO Bilgiyi Ticarileştirme ve Araştırma Vakfı Yönetim Kurulu Başkanı; İTO Eğitim ve Sosyal Hizmetler Vakfı Yönetim Kurulu Başkanı; TUGEV (Turizm Geliştirme ve Eğitim Vakfı) Yönetim Kurulu Başkanı. Avdagiç, aynı zamanda otomotiv sektöründe faaliyet gösteren bir şirketin Yönetim Kurulu Başkanıdır.