MYS (Mali Yönetim Sistemi)'nde yapılan bazı işlemler şunlardır: Harcama işlemleri: Harcama Talimatı Onay Belgesi ve Ödeme Emri Belgesi hazırlama, gerçekleştirme görevlisi ve harcama yetkilisi onay süreçleri. Yolluk işlemleri: Yurtiçi ve yurtdışı geçici görev yollukları ile denetim elemanı yolluklarına ilişkin işlemler. E-fatura işlemleri: E-fatura talep ve görüntüleme işlemleri. Ödenek işlemleri: Ödenek belgesi ve talep işlemleri. Taahhüt işlemleri: Taahhüt dosyası işlemleri. Taşınır işlemleri: Taşınır mal alım ve diğer taşınır işlemleri. MYS'ye, "mysv2.hmb.gov.tr" veya "mys.muhasebat.gov.tr" adreslerinden kullanıcı adı ve şifre ile giriş yapılarak erişilebilir.