Uygurca ve Doğu Türkistan dili aynı değildir. Uygurca, Türk dillerinin Uygur grubunda yer alan bir dildir ve Yeni Uygurca veya Yeni Uygur Türkçesi olarak da bilinir. Uygurca, tarih boyunca Köktürk, Mani, Uygur, Soğut, Nestoriyan, Tibet, Brahmi, Pasba, Arap, Kiril ve Latin alfabeleri gibi çeşitli alfabelerle yazılmıştır.