Eczaneler eskiden genellikle hastanelerde bulunuyordu. Anadolu'daki ilk eczaneler, Selçuklu döneminde kurulan hastanelerde açılmıştır. İstanbul'da ise Avrupa'dakilere benzer ilk özel eczaneler, 18. yüzyılın ortalarında yabancı uyruklu eczacılar tarafından açılmıştır. Osmanlı döneminde ise eczaneler genellikle yabancı uyrukluların ve azınlıkların tekelindeydi.