"Çünkü" kelimesinin kökeni Farsça'dır 123.

Farsça "çūn" (böyle, şunun gibi) ve "ki" (ilgi edatı) sözcüklerinin birleşimiyle oluşmuştur 12.

Nihai kökeni belirsiz olsa da, bazı araştırmacılar Türkçe kökenli olduğunu öne sürerken, diğerleri bu görüşün aksine Farsça ve diğer dillerdeki benzer sözcüklerin varlığını işaret ederek aksi bir görüş savunmaktadır 15.