C3 ve C4 seviyeleri, bağışıklık sistemini izlemek, otoimmün hastalıkların aktivitelerini takip etmek ve tedaviye yanıtlarını gözlemlemek için kullanılan tamamlayıcı proteinlerdir. C3 seviyesi: Normal değeri 41-90 hemolitik ünite arasında değişir. Düşük C3 seviyeleri, karaciğer sirozu, anemi, şiddetli sepsis, hepatit, lupus nefriti ve romatoid artrit gibi durumlarla ilişkili olabilir. Yüksek C3 seviyeleri, kanser, enfeksiyon hastalıkları ve ülseratif kolit gibi durumlarla ilişkili olabilir. C4 seviyesi: Normal değeri erkekler için 12-72 mg/dl, kadınlar için 13-75 mg/dl arasında değişir. Düşük C4 seviyeleri, kalıtsal olmayan otoimmün hastalıklarla ilişkili olabilir. Yüksek C4 seviyeleri, genellikle otoimmün hastalıklar ve lupus ile ilişkilidir. C3 ve C4 seviyelerinin ölçümü, doktor tarafından bağışıklık sistemi bozukluğundan şüphelenildiğinde istenir.