Vibrio cholerae için primer tasarımı, karşılaştırmalı genomik ve bioinformatik analiz kullanılarak yapılır. İşte genel adımlar: 1. Genlerin Taranması: Vibrio cholerae'ye özgü genler, NCBI veritabanındaki referans dizilerle karşılaştırılarak seçilir. 2. Primer Tasarımı: Seçilen genlere özgü primerlerin tasarımı, erime sıcaklığı (Tm), PCR ürün boyutu ve hedef genlerdeki korunmuş (veya değişken) bölgeler gibi kriterlere göre yapılır. 3. Özgüllük Testi: Tasarlanan primerlerin özgüllüğü, Vibrio cholerae ve diğer bakteri türlerinin DNA'sı üzerinde tek başına PCR yapılarak doğrulanır. 4. QPCR Kiti: Alternatif olarak, Vibrio cholerae'nin in vitro kantitasyonu için, 100% homoloji sunan ve NCBI veritabanının %95'inden fazla referans dizisiyle uyumlu primerler içeren QPCR kitleri de kullanılabilir.