• Buradasın

    V. cholerae hangi primerler ile ayırt edilir?

    Yazeka

    Arama sonuçlarına göre oluşturuldu

    V. cholerae bakterisi, aşağıdaki primerler ile ayırt edilebilir:
    • Biyokimyasal testler:
      • Oksidaz testi: V. cholerae oksidaz pozitiftir, bu da onu Enterobacteriaceae gibi oksidaz negatif bakterilerden ayırır 5.
      • String testi: Vibrio cinsini (çoğunlukla pozitif) Aeromonas'tan (neredeyse her zaman negatif) ayırt etmek için kullanılan hızlı ve basit bir yöntemdir 5.
    • Serolojik gruplama:
      • V. cholerae, serolojik olarak O1 ve O139 serogrupları olarak gruplandırılır 34. O1 serogrup, epidemik öneme sahip olup kolera toksini oluşturur 4.
    • Kültürel özellikler:
      • Tatlı sularda yaşasa da halotolerant özelliği ile %4'e kadar tuz içeren sularda da üreyebilir 4.
      • Optimum ürediği su aktivite değeri (aw) 0.98 olup 0.97-0.99 aralığında da gelişebilir 4.
    Kesin tanı için dışkı (gaita) testi ve TCBS (Thiosulphate citrate bile salt sucrose) agar kullanımı da önemlidir 134.
    5 kaynaktan alınan bilgiyle göre:

    Konuyla ilgili materyaller

    Vibrio cholerae primer tasarımı nasıl yapılır?

    Vibrio cholerae için primer tasarımı, karşılaştırmalı genomik ve bioinformatik analiz kullanılarak yapılır. İşte genel adımlar: 1. Genlerin Taranması: Vibrio cholerae'ye özgü genler, NCBI veritabanındaki referans dizilerle karşılaştırılarak seçilir. 2. Primer Tasarımı: Seçilen genlere özgü primerlerin tasarımı, erime sıcaklığı (Tm), PCR ürün boyutu ve hedef genlerdeki korunmuş (veya değişken) bölgeler gibi kriterlere göre yapılır. 3. Özgüllük Testi: Tasarlanan primerlerin özgüllüğü, Vibrio cholerae ve diğer bakteri türlerinin DNA'sı üzerinde tek başına PCR yapılarak doğrulanır. 4. QPCR Kiti: Alternatif olarak, Vibrio cholerae'nin in vitro kantitasyonu için, 100% homoloji sunan ve NCBI veritabanının %95'inden fazla referans dizisiyle uyumlu primerler içeren QPCR kitleri de kullanılabilir.