Dekantasyon ve santrifüj arasındaki temel fark, karışımları ayırma prensiplerinde yatmaktadır: Dekantasyon, katı-sıvı heterojen karışımlarda, katı tamamen çöktükten sonra, üstte kalan sıvının dikkatlice başka bir kaba aktarılması işlemidir. Santrifüj, yüksek hızda dönen bir hazne kullanarak santrifüj kuvveti oluşturur ve bu sayede daha yoğun olan katı maddelerin tabana çökmesini sağlar. Dolayısıyla, dekantasyon daha kaba bir ayırma yöntemi iken, santrifüj daha kesin ve hızlı bir ayırma sağlar.