Kimyasal ve elektriksel sinapslar arasındaki temel farklar şunlardır: Sinyal türü: Kimyasal sinapslarda sinyal kimyasal, elektriksel sinapslarda ise elektrikseldir. Hücreler arası mesafe: Kimyasal sinapslarda hücreler arası mesafe 20-30 nm iken, elektriksel sinapslarda bu mesafe 2 nm'den daha azdır. İletim yönü: Kimyasal sinapslarda iletim tek yönlüdür, elektriksel sinapslarda ise çoğunlukla çift yönlüdür. Hız: Elektriksel sinapslar çok hızlı iletime sahipken, kimyasal sinapslar daha yavaştır. Yayılma: Elektriksel sinapslarda uyarı, presinaptik hücreye geri dönerek transmitter salınımını güçlendirebilir ve çevredeki sinaptik terminallere yayılabilir. Ayrıca, elektriksel sinapslar nöral devrelerin aktivitesini modifiye edebilecek özelliklere sahiptir ve aktivite-bağımlı olarak kompozisyonlarını, iletkenliklerini ve doğrultuculuklarını değiştirebilirler.