Cis-trans izomerizmi, moleküllerin aynı atomlara sahip olduğu, ancak uzamsal düzenlemelerinin farklı olduğu bir izomerizm türüdür. Cis ve trans önekleri, bu düzenlemedeki farkı belirtmek için kullanılır: - Cis: Fonksiyonel gruplar molekülün aynı tarafında bulunur. - Trans: Fonksiyonel gruplar molekülün zıt taraflarında bulunur. Bu tür izomerizm, hem organik hem de inorganik bileşiklerde görülebilir.