Protoplast ve sferoplast arasındaki temel fark, hücre duvarının durumudur: - Protoplast, bakteri veya mantar hücrelerinin hücre duvarının tamamen çıkarılmasıyla elde edilir; sadece hücre zarı ve sitoplazma kalır. - Sferoplast ise hücre duvarının bir kısmının çıkarılmasıyla oluşturulur; bu nedenle hücre zarı ve hücre duvarının bir kısmı hala mevcuttur, genellikle gram negatif bakterilerde bulunur.