Peptitler ve proteinler arasındaki temel farklar şunlardır: Boyut: Peptitler, 2 ila 50 amino asitten oluşan daha küçük yapılardır. Yapı: Peptitler, genellikle basit yapılara ve sınırlı katlanmaya sahipken, proteinler karmaşık üç boyutlu yapılar sergiler. Sentez: Peptitler, laboratuvarlarda kimyasal olarak veya organizmalarda biyolojik olarak sentezlenebilir. Fonksiyon: Peptitler, hormon, nörotransmitter, enzim veya sinyal molekülü olarak işlev görür. Her iki sınıf da amino asitlerden oluşsa da, peptitler daha spesifik ve kolay sentezlenebilirken, proteinler yapısal ve işlevsel karmaşıklık sağlar.