Mikroskopta kullanılan bazı kap çeşitleri: Lam: Cam malzemeden yapılmış, klinik örneklerin veya mikroorganizmaların incelenmesinde kullanılır. Lamel: Lamın üzerini kapatmak için kullanılan daha ince bir cam parçasıdır. Petri Kutusu: Steril edildikten sonra katı besiyeri dökülerek klinik örneklerin ekilmesi işleminde kullanılır. Tüp: Değişik boy ve çaplarda, genellikle kan veya çeşitli akıntıların konduğu silindirik bir cam malzemedir. Öze: Klinik örneklerin besiyerine yayılmasında veya bir besiyerinden diğerine mikroorganizma aktarılırken kullanılan, metal saplı ve tel uçlu bir araçtır. Eküvyon: Ucuna pamuk sarılmış, genellikle tahtadan yapılmış bir çubuktur. Pipet: Cam malzemeden yapılmış, sıvı çekme işlevi gören ince uzun borucuklardır. Cam Balon: Genellikle besiyerlerinin hazırlanmasında ve saklanmasında kullanılan, alt kısmı balon şeklinde üst kısmı ise silindir bir borudur. Mezur: Cam malzemeden yapılmış, üzerinde ml. cinsinden bölmeler bulunan bir ölçü kabıdır.