Fotosentezi etkileyen karanlık faktörler şunlardır: 1. CO2 Konsantrasyonu: Karanlık evre reaksiyonlarında kullanılan CO2 miktarının artması, fotosentez hızını artırır. 2. Sıcaklık: Enzimlerin katalizörlüğünde gerçekleşen karanlık evre reaksiyonları, optimum sıcaklık derecesinde maksimum hızda olur. 3. Su ve Mineraller: Fotosentezde su, elektron ve hidrojen kaynağı olarak kullanılır. 4. Genetik Faktörler: Kloroplast sayısı, klorofil miktarı, stoma sayısı ve yeri gibi kalıtsal özellikler de fotosentez hızını etkiler.