İzoelektronik atomlarda yarıçap, proton sayısına bağlı olarak değişir: Katyonlar arasında: Proton sayısı arttıkça, çekirdek elektronları daha güçlü çeker ve yarıçap küçülür. Katyon ve anyon arasında: İzoelektronik katyonların proton sayısı, anyonların proton sayısından daha fazla olduğundan, katyon yarıçapı anyon yarıçapından daha küçüktür. Örneğin, 11Na+ ve 9F- iyonlarında eşit sayıda onar tane elektron vardır ve bu iki iyon birbirinin izoelektroniğidir.