Hidrojen bağını en güçlü yapan faktörler şunlardır:
- Elektronegatiflik: Hidrojen bağında yer alan atomların elektronegatifliği yüksektir, özellikle oksijen, flor ve azot gibi atomlar .
- Bağ Sayısı: Hidrojen bağlarının sayısı arttıkça, bağın gücü de artar .
- Molekül Yapısı: Polar moleküller arasında hidrojen bağları daha güçlü olur .
Bu nedenle, hidrojen bağları van der Waals bağlarından daha güçlü, ancak kovalent veya iyonik bağlardan daha zayıftır .