Hidrojen bağını en güçlü yapan faktörler şunlardır: 1. Elektronegatiflik: Hidrojen bağında yer alan atomların elektronegatifliği yüksektir, özellikle oksijen, flor ve azot gibi atomlar. 2. Bağ Sayısı: Hidrojen bağlarının sayısı arttıkça, bağın gücü de artar. 3. Molekül Yapısı: Polar moleküller arasında hidrojen bağları daha güçlü olur. Bu nedenle, hidrojen bağları van der Waals bağlarından daha güçlü, ancak kovalent veya iyonik bağlardan daha zayıftır.