Karbon, azot ve oksijen döngüleri, doğada maddelerin canlılar tarafından tüketilip tekrar geri kazanılmasını sağlayan süreçlerdir. Karbon döngüsü şu şekilde gerçekleşir: 1. Fotosentez: Bitkiler, atmosferdeki karbondioksidi kullanarak besin üretir ve bu süreçte karbon, glikozun yapısına katılır. 2. Solunum ve Yanma: Üretilen besinler, besin zinciri yoluyla diğer tüketicilere aktarılır ve solunum ile yanma olayları sonucu karbondioksit atmosfere geri verilir. 3. Fosil Yakıtlar: Ölen bitki ve hayvanların kalıntıları, uzun süre toprak altında kalarak kömür ve petrol gibi fosil yakıtları oluşturur. Azot döngüsü ise şu şekildedir: 1. Atmosfer: Azot gazı, atmosferin %78'ini oluşturur ancak bitkiler ve hayvanlar tarafından doğrudan kullanılamaz. 2. Yıldırım ve Bakteriler: Yıldırım ve şimşek gibi doğa olayları ile azot bağlayıcı bakteriler, havadaki azotu azotlu bileşiklere dönüştürür. 3. Bitkiler ve Besin Zinciri: Toprağa geçen azotlu bileşikler bitkiler tarafından alınır ve besin zinciri ile diğer canlılara aktarılır. 4. Ayrıştırıcılar: Canlı atıkları ve ölülerin azotlu bileşikleri, ayrıştırıcı bakteriler tarafından parçalanarak tekrar azot gazı haline gelir ve atmosfere geri döner.