Fen bilimlerinde atom, atom altı parçacıklara ayrılır. Bu parçacıklar şunlardır: 1. Proton: Atomun çekirdeğinde bulunan pozitif yüklü parçacıklardır. 2. Nötron: Atomun çekirdeğinde bulunan yüksüz parçacıklardır. 3. Elektron: Atomun etrafında katmanlarda dönen negatif yüklü parçacıklardır. Ayrıca, atomlar izotop, izobar, izoton gibi sınıflandırmalara da ayrılabilir. İzotop: Aynı elementin atomları olup, proton sayıları aynı, kütle numaraları farklıdır. İzobar: Atom numaraları farklı, kütle numaraları aynı olan atomlardır. İzoton: Nötron sayıları aynı, proton sayıları farklı olan atomlardır.