Renk değiştiren bakteriler, iki ana mekanizma ile renk değiştirebilir: yapısal renk ve pigmentler aracılığıyla. 1. Yapısal Renk: Bu tür bakteriler, koloniler halinde bir araya gelerek nano yapılar oluşturur ve bu yapılar ışığın yansımasını ve karışmasını sağlayarak belirli dalga boylarını yansıtır. 2. Pigmentler: Bazı bakteriler, koloninin içinde kalan veya ortama geçen suda çözünebilen pigmentler üretir.