• Buradasın

    DNA ve 3B yapı veritabanları nelerdir?

    Yazeka

    Arama sonuçlarına göre oluşturuldu

    DNA ve 3B yapı veritabanları şunlardır:
    1. GenBank: NCBI (National Center for Biotechnology Information) tarafından oluşturulan, nükleotid dizilimlerinin depolandığı bir veritabanıdır 12.
    2. WGS (Whole Genome Shotgun): Tamamlanmamış nükleotid dizilimlerinin saklandığı bir veritabanıdır 1.
    3. PDBe (Protein DataBank in Europe): Avrupa tabanlı, protein, RNA ve DNA gibi moleküllerin 3D yapılarını arşivleyen bir veritabanıdır 13.
    4. PDB (Protein DataBank): Amerika tabanlı, benzer bir işlevi gören başka bir veritabanıdır 2.
    5. UniProt: Proteinlerin yapısı hakkında bilgi içeren bir veritabanıdır 13.

    Konuyla ilgili materyaller

    DNA'nın yapısı nedir?

    DNA (deoksiribonükleik asit), tüm organizmaların ve bazı virüslerin canlılık işlevleri ve biyolojik gelişmeleri için gerekli olan genetik talimatları taşıyan bir nükleik asittir. DNA'nın yapısı: Nükleotidler: DNA, nükleotid birimlerinden oluşur. Çift Sarmal Yapı: DNA, bükülmüş bir merdivene benzeyen çift sarmal bir yapıya sahiptir. Hidrojen Bağları: DNA'nın yapısındaki iki zincir, bazlar arasındaki hidrojen bağları ile birbirine tutunur. Anti-paralel Yapı: DNA iplikçikleri anti-paralel yapıdadır, yani iplikçiklerden birinin son şekerinde 3. karbon yukarı bakarken diğerinde 5. karbon yukarıda olur. DNA, ökaryot canlılarda hücre çekirdeği içinde, prokaryot canlılarda ise sitoplazmada yer alır.

    DNA analizinde hangi yöntemler kullanılır?

    DNA analizinde kullanılan bazı yöntemler: Jel Elektroforezi: DNA ve RNA parçalarının boyutlarını ayırt etmek için kullanılır. Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR): DNA parçalarını kopyalamak için kullanılır. Sanger Dizileme: DNA molekülünün nükleotid dizisinin belirlenmesini sağlar. Maxam-Gilbert Yöntemi: DNA'yı kimyasallarla keserek nükleotid dizisini saptar. Tüm Genom Dizilimi (WGS): Bireyin tüm genetik yapısını detaylı inceleyerek genetik hastalıkları ve sağlık risklerini tespit eder. Tüm Ekzon Dizilimi (WES): Genlerde protein kodlayan bölgeleri analiz ederek genetik hastalıkların nedenlerini araştırır. Adli DNA Testi: Suç soruşturmalarında veya babalık davalarında kimlik doğrulama için kullanılır. STR Analizi: Akraba olmayan kişilerde farklı sayıda tekrar eden DNA bölgelerine bakarak ayrım yapar. Kullanılacak yöntem, analiz gereksinimlerine, numunenin özelliklerine ve laboratuvarın imkanlarına bağlı olarak değişir.

    DNA nasıl çalışır?

    DNA, iki ana süreç aracılığıyla çalışır: transkripsiyon ve translasyon. Transkripsiyon aşamasında, DNA'daki genetik bilgi, RNA (ribonükleik asit) molekülüne aktarılır. Translasyon aşamasında, RNA molekülü, ribozomlarda protein sentezine dönüşür. Ayrıca, DNA'nın diğer önemli işlevleri şunlardır: - Genetik bilgi taşıma: DNA, organizmanın tüm kalıtsal bilgilerini taşır ve bu bilgiyi nesilden nesile aktarır. - Hücre bölünmesi: DNA, hücre bölünmesi sırasında kopyalanır ve böylece yeni hücrelere genetik bilgi aktarılır.

    DNA yapısındaki bağlar nelerdir?

    DNA yapısında bulunan bağlar şunlardır: Fosfodiester bağı. Hidrojen bağı. Ayrıca, DNA yapısında bulunan nükleotitlerin sayıları ve dizilişlerinin farklı olması, canlılar arasında görülen çeşitliliğin temel nedenlerinden biridir.

    A ve B DNA arasındaki fark nedir?

    A-DNA ve B-DNA arasındaki temel farklar şunlardır: Sarmal yönü: Her ikisi de sağa doğru (sağ-el) sarmal gösterir, ancak A-DNA daha kısa ve daha büyük çaplı bir yapıya sahiptir. Bazların konumu: B-DNA'da bazlar sarmal eksenine dik olarak bulunurken, A-DNA'da bazlar eksene dik değil, eğik ve yatay olarak yer alır. Tam dönüşteki baz çifti sayısı: B-DNA'da tam bir dönüşte 10,4 baz çifti bulunurken, A-DNA'da bu sayı 11'dir. Çap: B-DNA'nın çapı yaklaşık 20 Å, A-DNA'nın çapı ise 23 Å'dır. B-DNA, çoğu canlıda bulunan ve hücresel DNA'nın büyük bir kısmını oluşturan formdur.

    Türkiye'de DNA veri bankası var mı?

    Evet, Türkiye'de DNA veri bankası bulunmaktadır. Adalet Bakanlığı tarafından hazırlanan "DNA Verileri ve Milli DNA Veri Bankası Kanunu Tasarı Taslağı" ile kimlik tespiti veya adli amaçla DNA örneklerinin alınması, analiz yapılması, verilerin saklanması, verilerden yararlanılması ve Türkiye Milli DNA Veri Bankası'nın kuruluş ve görevlerine ilişkin esas ve usulleri düzenlemek amacıyla Türkiye Milli DNA Veri Bankası kurulmuştur. DNA veri bankası sistemi, adli amaçlı ve diğerleri olmak üzere iki ana dizinden oluşmaktadır.

    3B yapı sınıfı nedir?

    3B yapı sınıfı, yapı sınıfları sınıflandırmasında bir kategori değildir. Ancak, yapı sınıfları şu şekilde gruplandırılabilir: I. Sınıf Yapılar: Basit tarım ve hayvancılık yapıları, çardaklar, gölgelikler, ihata duvarları, plastik örtülü seralar gibi yapılar. II. Sınıf Yapılar: Konutlar, okullar, dispanserler, bürolar, fabrikalar, benzin istasyonları, lokantalar gibi yapılar. III. Sınıf Yapılar: A Grubu (normal konut binaları, küçük sanayi siteleri) ve B Grubu (oteller, yurtlar, alışveriş merkezleri) yapılar. IV. Sınıf Yapılar: İş merkezleri, metro istasyonları, stadyumlar, büyük postaneler, eğlence amaçlı yapılar gibi yapılar. V. Sınıf Yapılar: Alışveriş kompleksleri, kongre merkezleri, hastaneler, havalimanları, büyük kütüphaneler gibi yapılar. Daha fazla bilgi için ilgili yönetmeliklere ve kaynaklara başvurulması önerilir.