Denizin dibinde birçok gizemli olay ve yapı bulunmaktadır: 1. Mariana Çukuru: Okyanusların en derin noktası olup, burada hala keşfedilemeyen deniz canlıları olduğu düşünülmektedir. 2. Baltık Denizi Kalıntısı: Denizin 300 metre altında keşfedilen garip bir şekil, uzaylılardan gizli savaş teknolojilerine kadar çeşitli komplo teorilerine yol açmıştır. 3. Kayıp Denizaltılar: 1968 yılında aynı yıl içinde dört farklı ulusa ait denizaltı kaybolmuştur. 4. Yonaguni Anıtı: 1985'te keşfedilen dev merdiven benzeri yapılar, kimler tarafından ve hangi amaçla inşa edildikleri tespit edilememiştir. 5. Derin Su Fotosentezi: Güneş ışınlarının ulaşamadığı derin denizlerde, bazı bakterilerin havalandırma kanallarının loş kırmızı parıltısını kullanarak fotosentez yapması gizemini korumaktadır.