Bir bileşiğin molekül yapılı olup olmadığını anlamak için aşağıdaki kriterlere bakılabilir: 1. Kimyasal Bağlar: Moleküller, atomlar arasındaki kovalent bağlarla oluşur. Eğer bir bileşikte bu tür bağlar varsa, moleküler bir yapı olduğu söylenebilir. 2. Formül: Moleküler bileşikler, belirli bir formüle sahiptir ve belirli atomların sabit bir oranı ile bir araya gelerek oluşur. 3. Fiziksel Durum: Moleküler bileşikler genellikle gaz, sıvı veya düşük erime noktasına sahip katı halinde bulunur. 4. İyonik Yapı: Eğer bileşikte metal ve ametal atomlarının birleşimi varsa, bu genellikle iyonik bir bileşiktir ve moleküler yapıdan ziyade bir kristal yapı oluşturur. Ayrıca, laboratuvar ortamında spektroskopi ve diğer analitik yöntemler kullanılarak da bileşiğin moleküler yapısı belirlenebilir.