Alaşehir Kongresi'nde alınan bazı önemli kararlar şunlardır: 1. Yunan İşgaline Karşı Direniş: Yunan işgaline karşı sonuna kadar mücadele edileceği kararlaştırıldı. 2. Kuvâ-yi Milliye'nin Güçlendirilmesi: Silahlı direniş için Kuvâ-yi Milliye birliklerinin güçlendirilmesi benimsendi. 3. Bağımsızlık Vurgusu: İşgalcilerle iş birliği yapılmayacağı, bölgenin bağımsızlığının korunacağı ifade edildi. 4. İstanbul Hükümeti'ne Karşı Tutum: İstanbul Hükümeti'nin zayıf ve etkisiz politikaları eleştirildi, halkın kendi kaderini tayin etmesi gerektiği vurgulandı. 5. Manda ve Himaye Karşıtlığı: Bölgenin herhangi bir devletin mandasına girmesine karşı çıkıldı, tam bağımsızlık hedefi benimsendi. 6. Bölgesel Savunma Güçleri: Batı Anadolu'da yerel halktan oluşan savunma güçleri oluşturulması gerektiği kararı alındı. 7. İşbirliği ve Koordinasyon: Bölgedeki direniş örgütleri arasında iş birliği ve koordinasyon sağlanması kararlaştırıldı.