Babil Krallığı'nın yıkılmasının birkaç nedeni vardır: İç huzursuzluk: Son kral Nabonidus'un yönetimi, halk ve Marduk rahipleri arasında hoşnutsuzluğa yol açtı. Dış baskılar: Babil, özellikle Asur'un zayıflamasıyla daha savunmasız hale geldi ve MÖ 539'da Ahameniş İmparatorluğu'na (Persler) karşı koyamadı. Askeri zayıflık: Nabonidus'un Asur'da tapınakları yeniden inşa etmek için Babil'den ayrılması, savunmayı zayıf bıraktı. Babil, MÖ 539 yılında Pers Kralı Büyük Kiros tarafından fethedildi ve Yeni Babil İmparatorluğu sona erdi.