Havza ve Amasya Genelgesi arasındaki bazı farklar şunlardır: Yayınlanma Zamanı: Havza Genelgesi 28 Mayıs 1919'da, Amasya Genelgesi ise 22 Haziran 1919'da yayınlanmıştır. İçerik: Havza Genelgesi: İzmir'in işgalinin haksız olduğunu belirtmiş, işgallerin protesto edilmesini istemiş ve azınlıklara zarar verilmemesini vurgulamıştır. Amasya Genelgesi: Milli Mücadelenin amacını, gerekçesini ve yöntemini belirtmiş, milletin bağımsızlığını yine milletin azim ve kararının kurtaracağını ifade etmiştir. Hazırlık: Havza Genelgesi, Mustafa Kemal Paşa'nın tek başına hazırladığı bir genelgeyken, Amasya Genelgesi, Mustafa Kemal Paşa'nın bazı arkadaşlarıyla birlikte hazırladığı ve onların onayıyla yayınlanan bir genelgedir.