Amasya Genelgesi'nde yer alan temel ilkeler şunlardır: 1. Vatanın Bütünlüğü ve Milletin Bağımsızlığı Tehlikededir: Ülkenin bütünlüğü ve milletin bağımsızlığı tehlikede olduğu belirtilmiştir. 2. İstanbul Hükümeti Sorumluluğunu Yerine Getirememektedir: İstanbul Hükümeti'nin üzerine düşen görevleri yerine getiremediği ifade edilmiştir. 3. Milletin Bağımsızlığını Yine Milletin Azim ve Kararı Kurtaracaktır: Kurtuluşun milletin kendi kararlılığı ile mümkün olacağı vurgulanmıştır. 4. Milli Bir Heyetin Oluşturulması Gereklidir: Milli iradeyi temsil edecek bir heyetin kurulması gerektiği belirtilmiştir. 5. Sivas'ta Milli Kongre Toplanması: Sivas'ta milli bir kongrenin toplanması kararlaştırılmıştır. 6. Askeri ve Milli Örgütlerin Lağvedilmemesi: Askeri ve milli örgütlerin dağıtılmaması gerektiği vurgulanmıştır.