Amasya Genelgesi'nin 6. maddesi, askeri ve milli teşkilatlanmanın kesinlikle kaldırılmayacağını, emir ve komutanın hiçbir makama terk edilmeyeceğini, silah ve cephanelerin elde tutulacağını belirtir. Bu madde ile, ileride örgütlenip milli direnişte kullanılmak üzere eldeki silah ve cephanelerden en verimli şekilde yararlanılması amaçlanmıştır. Amasya Genelgesi'nin diğer maddeleri ise şu şekildedir: Vatanın bütünlüğü ve milletin bağımsızlığı tehlike altındadır ve korunmalıdır. İstanbul hükümeti bu görevi yapamadığı için milletimiz yokmuş yerine konulmaktadır. Milletin bağımsızlığını yine milletin azim ve kararı kurtaracaktır. Milletin sesini dünyaya duyurmak için hiçbir baskı altında olmayan bir milli heyet kurulmalıdır. Sivas’ta en kısa zamanda bir milli kongre toplanmalıdır. Doğu illeri adına 10 Temmuz’da Erzurum’da bir kongre toplanacaktır.