Agua Yanardağı, çamur akışları ve toprak kaymaları nedeniyle tehlikeli olarak kabul edilir. Bunun yanı sıra, yanardağın geçmişte volkanik aktivite göstermiş olması ve resmi olarak kaydedilmiş patlamalarının bulunması, potansiyel bir tehlike oluşturduğunu gösterir. Ayrıca, Agua Yanardağı'nın etki alanında yoğun nüfuslu bölgelerin yer alması, bir patlama durumunda can ve mal kaybı riskini artırır.