Peugeot 406'nın en çok tutulan motor seçeneği 2.0 litredir. Peugeot 406'nın diğer motor seçenekleri ve yaklaşık yakıt tüketimleri şu şekildedir: 1.8 Benzinli: 90 beygir, şehir içinde 11,8 litre, şehir dışında 6,4 litre. 2.2 Benzinli: 158 beygir, şehir içinde 12,8 litre, şehir dışında 6,7 litre. 3.0 Benzinli: 190 beygir, şehir içinde 16,1 litre, şehir dışında 8,2 litre. Ayrıca, 1.8 16V (110 Hp) motor seçeneği de tercih edilen varyantlar arasındadır.