Adalet Birliği: Apokolips Savaşı, Justice League Dark animasyon filminin devamı niteliğinde olup, "Darkseid Savaşı" ve "Final Crisis" gibi çizgi roman hikayelerine dayanmaktadır. Filmde, Adalet Birliği, Adalet Birliği Karanlık, Genç Titanlar ve İntihar Timi, dünyayı istila eden Darkseid'e karşı bir araya gelir. Hikayenin ana olayları: Superman, güçlerinden arındırılmış ve dünyaya ibret olsun diye sağ bırakılmıştır. Batman, Damian'ı öldürmekle görevlendirilir, ancak tereddüt eder ve bu, onun Darkseid'in kontrolünden kurtulmasını sağlar. Trigon, Clark'ın bedenini ele geçirir ve Darkseid'e saldırır. Cyborg, kendini feda ederek Darkseid ve Trigon'u bir boşluk portalına sürükler. Zafer kazanılsa da, Batman, Dünya'nın magmasının %31'inin tükendiğini ve milyarlarca insanın öleceğini açıklar. Film, DC Animasyon Film Evreni'ne (DCAMU) bir son verirken, yeni bir ortak animasyon evreninin başlangıcını da işaret edebilir.