Ekşioğlu ailesinin kökeni, Oğuz Türkmen boylarından Bayındır boyuna dayanmaktadır. Ailenin, Trabzon Pontus Rum Devletinin 1461 yılında fethedilmesi sonrası bölgedeki Müslüman nüfusun artırılması çalışmaları çerçevesinde Trabzon'a yerleştirildiği düşünülmektedir.