Çanakkale Cumhuriyet Müzesi'nde şu eserler ve bölümler bulunmaktadır: 1. Arkeolojik Eserler: Prehistorik çağlardan günümüze kadar gelen süreçteki toplumların kültür ve sanat eserleri. 2. Troia ve Diğer Örenyerleri Kazıları: Troia, Assos, Apollon, Smintheion, Tenedos, Alexandreia Troas örenyerlerinden çıkarılan eserler. 3. Önemli Eserler: Mermer heykeller, mezar stelleri, mimari parçalar, bronz ve pişmiş toprak çanak-çömlekler, kandiller, heykelcikler, taş ve kemik aletler, cam süs eşyaları ve altın takılar. 4. Özel Sergiler: 6 bin parça özel eser, 2 kütüphane, 2 sergi salonu ve 1 seminer salonu. 5. Cumhuriyet Dönemi Eserleri: Çanakkale Savaşı, Millî Mücadele ve Cumhuriyetin ilk yıllarına dair özel eserler.