İstanbul fen liselerinde genellikle şu bölümler bulunmaktadır: Fen Bilimleri Bölümü: Fizik, kimya ve biyoloji derslerinin yoğun olarak işlendiği alan. Matematik Bölümü: Analitik düşünme, geometri, trigonometri, türev-integral gibi ileri seviye konuların öğretildiği bölüm. Bilgisayar Bilimleri: Programlama, algoritma, yapay zekâ temelleri gibi dersleri kapsayan alan. Mühendislik Temelleri: Elektrik, makine veya yazılım mühendisliği gibi alanlara giriş niteliğinde dersler içeren bölüm. Tıp ve Sağlık Bilimleri: Tıp fakültesine hazırlık amacıyla anatomi, genetik ve biyokimya gibi derslerin verildiği alan. Her okulun müfredatı farklılık gösterebileceğinden, tercih yapmadan önce detaylı araştırma yapmak önemlidir.