E-dönüşüm için kullanılabilecek bazı programlar şunlardır: e-MM, e-Fatura, e-Arşiv, e-Defter, e-İrsaliye gibi e-dönüşüm uygulamaları için çeşitli özel entegratörler ve yazılımlar kullanılabilir. Bu yazılımlardan bazıları: Mikro Yazılım: e-fatura, e-arşiv, e-irsaliye, e-serbest meslek makbuzu ve e-mutabakat gibi belgelerin düzenlenmesini sağlar. Link e-Fatura: Faturaların Gelir İdaresi Başkanlığı standartlarına uygun şekilde hazırlanıp gönderilmesini sağlar. İş zekâsı ve veri analitiği araçları: Tableau, Power BI, QlikView gibi araçlarla üretim ve pazarlama stratejileri belirlenebilir. Proje yönetim araçları: Trello, Asana, Jira, Microsoft Project, Smartsheet, Monday.com gibi uygulamalarla proje süreçleri yönetilebilir. Bulut bilişim hizmetleri: Google Drive, Dropbox, Microsoft One Drive, Amazon Web Services (AWS), Microsoft Azure, Google Cloud Platform (GCP), IBM Cloud gibi hizmetler kullanılabilir. Dijital pazarlama araçları: Çeşitli e-ticaret platformları ve sosyal medya yönetim araçları. E-dönüşüm için kullanılacak program seçimi, işletmenin ihtiyaçlarına ve sektörüne göre değişiklik gösterebilir.