Gökçepınar köylerinin kuruluş tarihleri farklılık göstermektedir: 1. Samsun'un Canik ilçesindeki Gökçepınar köyü, daha önceleri Sınamataş köyüne bağlı bir mahalle iken, 21 Haziran 1948 tarihinde köy statüsü kazanmıştır. 2. Batman'ın Gercüş ilçesindeki Gökçepınar köyü, 1928 yılı kayıtlarında Îsî olarak geçmektedir. 3. Çorum'un Merkez ilçesindeki Gökçepınar köyü ise Helenistik Dönem'de kurulmuş olup, Doğu Roma (Bizans) Dönemi'ne kadar iskân edilmiştir.