Mahkeme izinli ameliyatlar, genellikle cinsiyet değişikliği ameliyatları için gereklidir. Bu tür ameliyatlar, Türk Medeni Kanunu'nun 40. maddesine göre şu koşullarda gerçekleştirilebilir: Başvuru sahibinin 18 yaşını doldurmuş olması. Evli olmaması. Transseksüel yapıda olup, cinsiyet değişikliğinin ruh sağlığı açısından zorunluluğunu bir eğitim ve araştırma hastanesinden alınacak resmi sağlık kurulu raporuyla belgelemesi. Tüm bu şartlar sağlandığında, mahkemenin vereceği iznin akabinde ameliyat gerçekleştirilebilir. Diğer ameliyatlar için mahkeme izni genellikle gerekli değildir. Ancak, bazı özel durumlarda (örneğin, acil tıbbi müdahaleler) mahkeme kararı gerekebilir.