BMW E92 M3'ün tutulmama nedenleri arasında emisyon kısıtlamaları, verimlilik gereklilikleri ve daha düşük yakıt tüketimi talepleri nedeniyle V8 motorlu M3 Coupe üretimine son verilmesi bulunmaktadır. Ayrıca, E92 M3'ün rod bearing (rulman) arızası, gaz kelebeği aktüatör arızası, VANOS sistemi sorunları, diferansiyel problemleri, tahrik mili ve CV eklem sorunları, hizalama problemleri, elektriksel arızalar ve iç trim aşınması gibi bilinen sorunları da bulunmaktadır. Bu sorunlar, bazı kullanıcılar için dezavantaj olarak görülebilir ve bu nedenle E92 M3'ün ikinci el piyasasında değer kaybetmesine yol açabilir.