Naruto mangasının ilk bölümü olan "Naruto Uzumaki!!" (うずまきナルト!!, Uzumaki Naruto!!) şu olayları anlatır: Dokuz-Kuyruklu Şeytan Tilki, shinobi köyü Konohagakure'ye saldırır ve Dördüncü Hokage tarafından durdurulur. On iki yıl sonra, Naruto Uzumaki yetim bir gençtir ve köylülerin ilgisini çekmek için şakalar yapar. Naruto, Hokage Anıtı'nı boyar ve köy lideri Üçüncü Hokage'yi görür. Öğretmeni Iruka Umino, Naruto'yu Akademi'ye geri getirir. Iruka, her öğrencinin Dönüşüm Tekniği yapmasını ister, ancak Naruto Seksi Teknik'i kullanır. Dersten sonra Iruka, Naruto'yu gece ramen yemeye götürür ve ona şakalarını sorar. Naruto, Hokage olma planlarını anlatır. Final sınavında Naruto, Klon Tekniği'ni kullanamaz ve Iruka onu yine başarısız bulur. Mizuki, Naruto'ya ninja olabilmesi için gizli tekniklerden birini öğrenmesi gerektiğini açıklar. Naruto, Üçüncü Hokage'nin odasındaki gizli belgeyi çalar. Iruka, Naruto'yu Mizuki'nin saldırılarından korur. Mizuki, belgeyi ele geçirmek ister ve Naruto'yu öldürmeye çalışır. Bütün bunlardan bunalan Naruto, ormana kaçar. Iruka ve Mizuki karşı karşıya gelirken, Naruto onları dinler. Mizuki, Naruto'nun parşömeni intikam için kullanacağını söyler. Iruka, Naruto'yu kabul etmeden önce canavarın eylemleri için onu suçlamadığını söyler. Kabul edildiğini öğrenen Naruto ortaya çıkar ve Gölge Kopyalama Tekniği ile Mizuki'yi yener. Iruka, Naruto'yu resmi olarak ninja yapar ve Hokage olabileceğine inanır.