Yenikapı Marmaray'dan gidilebilecek bazı yerler: Tramvay ile aktarma: Yenikapı veya Sirkeci istasyonlarından yapılabilir. Metro ile aktarma: Ataköy, Bakırköy, Bostancı, Ayrılıkçeşmesi, Gebze, Üsküdar ve Yenikapı Marmaray duraklarından metroya direkt aktarma yapılabilir. İDO ile aktarma: Yenikapı, Sirkeci, Pendik, Bostancı ve Bakırköy istasyonlarından İDO'ya aktarma yapılabilir. Banliyö ile aktarma: Halkalı, Sirkeci veya Kazlıçeşme duraklarından banliyö hattına aktarma yapılabilir. Hızlı tren ile aktarma: Halkalı, Bakırköy, Kadıköy Söğütlüçeşme, Bostancı veya Pendik istasyonlarından hızlı trene aktarma yapılabilir. Ayrıca, Yenikapı Marmaray istasyonu, İstanbul’un en merkezi ve entegre ulaşım merkezlerinden biridir. Detaylı ve güncel sefer saatleri için resmi Marmaray web sitesinin ziyaret edilmesi önerilir.