Age of Empires ve Age of Mythologies aynı değildir, ancak bazı benzerlikler taşırlar. Age of Mythologies, Age of Empires serisinin bir oyunu olup, oyuncuları kahramanların mitolojik yaratıklarla savaştığı ve tanrıların ölümlülerin işlerine karıştığı bir zamana taşır. Age of Empires ise, zengin bir tarihsel bağlam sunarak oyuncuların farklı medeniyetler, kültürler ve tarihi olaylar hakkında bilgi edinmesini sağlar. İki oyun arasındaki bazı farklar: Oynanış: Age of Mythologies daha sakin bir oyun olup, kahraman ve 20-25 kişilik bir orduyla oynanır. Grafik ve Tasarım: Age of Mythologies, bloklu ve çirkin görünen çokgenler kullanırken, Age of Empires'ın önceden işlenmiş sprite'ları daha iyi yaşlanmıştır. Fraksiyonlar: Age of Mythologies'de daha sınırlı sayıda medeniyet (başlarda 3, sonra 4 ve 5) bulunur.