Sterilize etmek için kullanılan yöntemler dört ana kategoriye ayrılır: 1. Isı ile sterilizasyon: Mikroorganizmaların protein yapılarının koagülasyonu (katılaşması) yoluyla gerçekleşir. Bu yöntemde kullanılan bazı ısı ile sterilizasyon yöntemleri: - Kuru sıcak hava: Cam ve metal aletler 175°C’de 1 saat, 165°C’de 2 saat, 150°C’de 3 saat ve 120°C’de 8 saat süreyle sterilize edilir. - Basınçlı buhar ile sterilizasyon (otoklav): Buharla doymuş ortamda ve 121°C’de 15 dakika, 115°C’de 30 dakika süreyle yapılır. - Kaynatma: Sıvı maddelerin kaynatılarak mikroorganizmaların öldürülmesi sağlanır. 2. Kimyasal madde ile sterilizasyon: Kimyasal maddeler, mikroorganizmaların hücre yapısını bozarak sterilizasyon sağlar. Bu yöntem, genellikle ısıya dayanıklı olmayan malzemeler için kullanılır. 3. Işınlama ile sterilizasyon: Ultraviyole (UV) ışınları, X ışınları veya gama ışınları gibi yüksek enerjili ışınlar kullanılarak yapılır. 4. Pastörizasyon: Mikroorganizmaların öldürülmesi için kullanılan bir ısıtma işlemidir ve özellikle süt ve süt ürünlerinde uygulanır.